膀胱软斑是一种炎症性疾病，需要长期使用抗生素治疗来改善症状，但容易复发。一些学者提出，使用各种抗生素治疗可以消失尿液中的细菌，但不能阻止病程的进展，因为一般的抗生素只能消除细胞外间隙的细菌，但不能杀死进入细胞的细菌。实践证明，利福平和磺胺异恶唑等一些抗生素可以进入吞噬细胞，帮助杀死细胞中的细菌。
近年来，喹诺酮类化合物以其独特的组织渗透性越来越受到重视。巨噬细胞中喹诺酮类化合物的高浓度对去除细胞中的病原菌非常有益。许多研究表明，环丙沙星是500mg2次/d口服，单纯治疗软斑效果好，效率90％。
发现膀胱软斑采用依诺沙星6000mg1次/d，口服治疗8周后，病理损伤完全消失。除了长期使用抗菌药物外，膀胱软斑还可以通过尿道进行电灼治疗，有利于病变的愈合。由于该病易复发，需要定期随访膀胱镜检查。
