咽侧脓肿的发生可由炎症、脓肿、感染等因素引起，具体原因如下。
1、邻近组织炎症：如急性咽炎、扁桃体炎、急性鼻炎、鼻窦炎等，直接侵入或血液感染侵入咽旁形成脓肿。
2.邻近组织脓肿:扁桃体周围脓肿、咽后脓肿、牙槽脓肿、颞骨岩脓肿、耳源性颈深脓肿等直接溃烂或延展（Bezold氏脓肿等，均可引起本病。
3.咽侧壁异物或器械损伤引起的感染：如鱼刺刺伤、内窥镜检查时的损伤等，炎症扩散到咽侧间隙，可形成脓肿；咽喉或口腔手术，如扁桃体切除术或拔牙，麻醉针可直接将细菌带入咽侧间隙引起感染。
4.其他:扁桃体周围脓肿切开排脓时，咽缩肌误穿透也会引起这种疾病。
