本病一般实验室常规检查正常，当合并感染时，尿检白细胞增多，男性尿道下裂性染色质为阴性，性染色体为XY，尿内17-酮类固醇正常，性腺活检为睾丸。除实验室检查外，还可进行辅助检查，具体情况如下。
1、17酮类固醇检查：尿液中17酮类固醇的升高表明肾上腺皮质增生，女性假性畸形的可能性最大。如果尿液中17酮类固醇正常，则不能排除女性假性畸形的可能性，需要进一步检查。
2、性染色质检查：经特殊染色后，常用于口腔粘膜上皮、阴道粘膜上皮、皮肤或白细胞。细胞核膜内部有染色质团突起和直径0.5～1.0μm，鼓槌状，称为性染色质。男女之间有明显的差异（由于染色方法不同，检查细胞不同，所以常数不同），女性染色质呈阳性10％以上(称为阳性)，男性在5％以下（称为阴性）用于临床识别性别。性染色质呈阳性，可否认尿道下裂，必须为女性假性畸形或真性性畸形。性染色质呈阴性，尿道下裂不确定，应进一步鉴别真性性畸形。
3、性染色体检查：如果条件允许，最好进行性染色体检查，这比性染色质检查更可靠。XX，如果是女性，可以排除尿道下裂。XY，除尿道下裂的可能性外，还需要进一步鉴别真正的畸形。
4、腹部B超：检查卵巢、子宫等。
5.内镜检查:后尿道看到阴道窝，说明有女性生殖道。看到精阜，说明是男性生殖道。如果两者都存在，说明除了尿道畸形，还有生殖道畸形，需要继续检查。
剖腹检查及性腺活检：如果17酮类固醇正常，性染色质为阴性，性染色体为阴性XY时，需行剖腹探查及性腺活体组织检查，才能与真性两性畸形相鉴别。
