透明细胞癌的真正原因仍不确定，认为有辐射、阳光、游离辐射，如铀、镭和紫外线。透明细胞癌的主要原因如下：
1、空气污染产生碳氧化合物，容易刺激呼吸道，导致肺透明细胞癌。饮食不当，如吃酸辣食物或腌蔬菜，容易患胃透明细胞癌，一些食品添加剂和着色剂也可能导致透明细胞癌。高脂肪食物可能与结直肠透明细胞癌和乳腺透明细胞癌有关。
2.一些发霉的食物，如酱汁或干湿，会产生霉素，可能导致透明细胞癌。特别是黄曲霉毒素，已被证实与肝透明细胞癌密切相关。
3些药物，如激素，也被怀疑与乳透明细胞癌、子宫透明细胞癌有关。
4.在个人习惯中，吸烟者比不吸烟者更容易患肺透明细胞癌20倍，口腔癌3-10倍，喉癌3-17倍。性生活的多少与妇女子宫透明细胞癌有关。
5.过滤性病毒和寄生虫
6.部分血液和淋巴癌与病毒有关，如软肿瘤、宫颈癌和鼻咽癌。
