婴幼儿皮肤粘膜淋巴结综合征易发生，本病一般需通过以下检查确诊：
1、血常规及血沉
大多数中性粒细胞增多，核左移，伴有中毒颗粒，嗜酸粒细胞一般在0.5％～2％，早期血红蛋白和红细胞略有下降，超过一半的患者在发病第2~3周血小板显著增加，骨髓巨核细胞增殖，这与血栓形成和心力衰竭有关，早期和恢复血小板凝血能力亢进，血液沉积加速。
2.尿常规
大约三分之一的患者有蛋白尿，一般认为是热蛋白尿，偶尔有管型，尿培养也有阳性，多为革兰阴性杆菌。
3.生化检查
部分患者急性期胆红素上升、转氨酶上升、C-反应蛋白强阳性，多数患者总蛋白下降，A/G下降、α2和γ球蛋白显著增加，部分患者乳酸脱氢酶升高，可超过500U。
4.免疫学检查
大多数患者总补体、免疫复合物和血小板凝集因子增加，IgG、IgM、IgA一般不变，抗“0”升高，约30％的患者ANCA和AECA阳性。
5.心电图检查
大约1/2患者有心电图变化，如ST段下降、T波低平或倒置，低压和传导阻滞。
6.超声心动图
超声心动图可见50％有一次性冠状动脉扩张，20％～30％发生动脉瘤，25％心包积液。
7.心血管造影
冠状动脉远端病变和管腔狭窄的程度可观察到心血管造影。
