国家临床重点专科呼吸科始建于20世纪40年代,系我国建科最早的呼吸内科之一,早在20世纪四十上年代即设立了呼吸科病房,时任公济医院院长朱仰高教授兼第一届肺科主任,1982年建立肺功能血气室,作为上海市血气质控中心使全市各级医院的血气分析质量明显提高,并于九十年代初在全国较早建立了呼吸危重症监护病房,开展的有创序贯无创通气治疗技术全国领先,成功救治了包括SARS,H1N1危重患者在内近千例各类危重症患者。目前,呼吸科经过几代人的不断努力,已发展成为拥有正高职称7人,副高职称7人,博士学位16人,博士生导师2人,硕士生导师3人肺功能技术人员7人,专科护士26人的专业技术核心团队;目前拥有住院床位70余张,重症监护床位8张。下设有现代化的呼吸病介入诊疗中心、肺功能检测室、睡眠呼吸监测室。呼吸科于2011年被国家卫生部列为\"国家临床重点建设专科\"。呼吸科承担国家自然基金项目、国家中医药管理局科研项目、\"十一五\"和\"863重大课题子项目,上海市科委和卫生局课题二十余项获国家发明及实用新型专利20余项,上海市优秀发明奖3项,\"支气管哮喘的基础研究和规范化诊治\"获2012年国家科技进步二等奖(合作单位),上海医学科技进步三等奖。举办呼吸科学科建设与管理学习班及慢性气道疾病疾病诊治新进展国家级医学继续教育培训班,在国内外发表学术论文200余篇,主编专著10余部。呼吸科承担上海市交通大学医学院、南京医科大学五年制七年制和八年制教学任务,培养博士研究生20余名硕士研究生30余名,与英国、瑞典、美国等多个著名大学及研究所合作。呼吸科负责人包括:学科带头人周新,科室主任张,执行主任(南部)贲素琴。