两性霉素是治疗急性侵袭性肺曲霉病的首选B，每天推荐成人剂量0.6mg/kg，2～3天后逐渐增加剂量，直到每天1.0mg/kg。两性霉素在高度可疑但未确诊的情况下经验性应用B治疗，如果疗程第7天没有疗效，应停止使用。
氟胞嘧啶(5-对肺曲霉病的抗菌活性通常较低，但与两性霉素有关B重症感染患者可联合使用，具有协同作用。其不良反应，特别是骨髓抑制，限制了其应用。
实验室数据证明了利福平和两性霉素B曲霉具有协同的抗菌活性，其肝毒性和免疫抑制作用也限制了其应用。伊曲康唑对曲霉具有良好的抗菌活性，并有成功治疗肺曲霉的报道。急性肺曲霉球有时会破裂，导致严重的系统传播，因此提倡所有适合手术的人都应进行手术切除。输注粒细胞作为辅助治疗，但有文献报道说，两性霉素B结合输注粒细胞增加肺毒性反应必须非常谨慎。有报道称，高剂量两性霉素B每天1.0mg/kg，联合氟胞嘧啶(5-在开始抗癌化疗之前，氟胞嘧啶被用来预防曲霉性肺炎的发作。
