Hughes-Stovin综合征的治疗包括药物治疗和手术治疗，具体治疗方法如下。
一、抗凝治疗
1、肝素：首剂50～75mg20~生理盐水40ml，静注，维持血凝时间(试管法)是正常对照者的2~3倍(20~35min)，以后每4～6h给50mg；也可200mg加5％静滴葡萄糖，维持24h。8~用于上述剂量10d减少到停药，或改变口服抗凝剂。
2、口服抗凝剂：华法令钠开始10~15mg/d，3～5d，凝血酶原时间适度延长(活动约定)15％～25％)调整剂量并维持12周，维持2~15mg/d。
3、溶血栓疗法：链激酶25万~50万U溶于5％～10％葡萄糖液或生理盐水100ml中，30min静脉滴完后，每小时10万U，维持24h，与肝素并用疗效更好。尿激酶也可以用20万。U静滴，每小时20万U，维持8～12h。有出血性疾病、严重高血压、糖尿病视网膜病变、消化道溃疡、近期大手术和过敏性素质的，禁止溶血栓治疗。
二、手术治疗
抗凝治疗无效，大或重复肺动脉栓塞，阻断肺循环>50％肺动脉高压患者适合手术治疗。确定栓塞部位的患者可以进行肺栓子切除术或下腔静脉阻断术，以减少盆腔和下肢栓子循环进入肺部。
