首先，我们应该注意疾病的预防。人类包囊虫病主要通过狗感染，应控制狗。加强牲畜管理，严格防止狗食用包囊虫病的生牛、羊、马肉。注意个人卫生，不要喝生水、生牛奶，特别是在牧区。骨包虫病的治疗主要是切除病骨。但有时很难完全切除所有的病变骨，你可以使用切除植骨的手术。也就是说，病变完全清除后，腔内使用20％用石炭酸甘油擦拭腔壁，10分钟后使用90％酒清洗灭活，然后用生理盐水反复冲洗骨腔，然后植入骨片。但在手术过程中，应特别注意防止子囊扩散和囊液外流引起过敏性休克的风险。病变刮除后，留下排水管，每天滴注20％～30％高渗氯化钠溶液，能杀死头节，效果好。
对于晚期病变晚期病变的患者，如果难以局部切除或刮除，可以考虑关节离断术或截断术，但当骨病变较长且软组织没有广泛侵入时，可以进行假体置换术。脊柱侵入时，应及时及早清除病变并植骨。截瘫合并时，应彻底清除病变，做脊髓减压和应用设备内固定，做植骨融合。
