肝胆管结石的诊断结石的临床认识外，确诊主要依靠影像学检查。本病的临床检查如下。
一、影像学检查
1、B超检查
肝内胆管结石方便易行，是肝内胆管结石诊断的首选方法。一般来说，肝内胆管结石的诊断只有在结石远端胆管扩张时才能进行，因为肝内管道系统的钙化也有结石样的图像表现。
2、CT或MRCP检查
由于肝胆管结石主要是含有胆红素钙的色素结石，钙含量高，所以在CT照片可以清晰。CT它还可以显示肝门的位置、胆管扩张、肝脏肥大和萎缩的变化。系统观察各个层次，了解肝内胆管结石的分布。胆管系统中的胆汁属于相对静止的液体，MRCP胆管系统的形态结构可以清晰显示。
3、X线胆道造影
是肝内胆管结石诊断的经典方法，一般都能做出正确的诊断。X线胆道造影应满足诊断和手术的需要，良好的胆道造影应能充分了解肝围，以满足诊断和手术的需要。
二、其它辅助检查
1.胆道测压
通过胆道压力测量，可以了解胆汁通过胆道排泄是否正常。胆道压力测量对某一分支肝内胆管结石的临床意义不大。然而，对于左右肝管接近肝门的结石，胆管狭窄可发现胆汁排泄不良，导致胆管扩张、胆汁潴留和胆管压力增加。现有的电子胆道压力测量仪应根据病情准确测量胆管内的压力。
2、核素扫描
常用核素99mTe，静脉注射后，通过网状内皮系统排入胆道。扫描时，可分层定点获取三维图像，显示与相邻结构的关系，为诊断提供良好依据。但肝内胆管结石的诊断并不理想。
3.选择性腹腔动脉造影
观察动脉血管是否有移位、压力、中断和异常血管影。对肝胆管癌和胆囊癌的鉴别和诊断效果良好，但对肝胆管结石的诊断并不理想。此外，动脉造影需要一定的设备，操作繁琐，技术条件高，不是肝胆管结石的首选。
