短肠综合征的诊断主要取决于病史和临床表现。主要临床检查方法如下：
血常规检查：患者可有缺铁性贫血或巨细胞性贫血。
2、血液生化检查：可有电解质紊乱及酸碱平衡失调，负氮平衡；血浆蛋白，脂类降低，类脂含量增多。
凝血酶原检查：可降低。
4、小肠对糖、蛋白质、脂肪吸收试验：均可降低。
必要时可进行胰腺功能检查和尿草酸排泄测定。
6.疑似小肠污染综合征可作为小肠液细菌的培养和计数，如超过107/ml者为阳性。
7、X线钡餐检查：可明确残留小肠的长度，肠内容物通过的时间，肠黏膜皱襞的情况，多次检查可作对比观察。
