去除病因后，垂体前叶功能减退症可长期替代靶腺激素。
1、肾上腺皮质激素
肾上腺皮质激素是治疗全垂体前叶功能减退的首选药物，应先替代甲状腺激素和性激素。氢化可的松(皮质醇)或可的松(皮质素)或泼尼松(强的松)是最小有效的替代剂量。严重感染、大手术等严重压力时，可给予氢化可的松静滴，避免危象。
2.甲状腺激素
小剂量的甲状腺激素开始逐渐增加到最小有效的替代量。补充肾上腺皮质激素1~2周后，可补充甲状腺素（L-T4），或者使用干甲状腺片，逐渐增加到维持量。当剂量较大时，可以分次服用。冠心病、心肌缺血或老年患者应更加注意从小剂量缓慢增加。
3.性激素
妇女在生育期应建立人工周期，恢复第二性征和性功能，防止骨质疏松用雄激素代替治疗，以维持第二性征和性欲。
4.其他治疗
其它治疗包括生长激素和一般对症治疗，儿童可在骨骺愈合前使用。
