藏毛窦和藏毛囊肿应与子、肛瘘和肉芽肿一起鉴别。疖子生长在皮肤上,皮肤突出,顶部呈黄色。痈有多个外孔,内部有坏死组织。肛瘘的外口靠近肛门,瘘管向肛门移动,并被诊断为索状物。肛管内有内口和肛肠脓中病史。藏毛窦的行走方向多向颅侧,很少向下。结核性肉芽肿与骨相连,X线性检查显示骨质受损,身体其他部位有结核病。梅毒性肉芽肿有梅毒病史,梅毒血清反应阳性。

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