1.链球菌感染后急性肾小球肾炎 应出现急性肾炎综合征IgA肾病识别，前者潜伏期长，有自愈倾向；后者潜伏期短，病情反复，结合实验室检查(如血液IgA及ASO)可资区别。
2.薄基底膜肾病 常为持续性镜下血尿，常有阳性血尿家族史，肾免疫病理显示IgA阴性，电镜下弥漫性肾小球基底膜变薄一般不难鉴别 。
3. 继发性IgA肾小球病(1)过敏性紫癜肾炎:肾病及免疫病理及IgA肾病是一样的，但前者通常有典型的肾外表现，如皮肤紫癜、关节肿胀疼痛、腹痛和黑便。（2）慢性酒精性肝硬化：50％～90％；可显示酒精性肝硬化患者的肾组织IgA免疫球蛋白沉积，只有少数患者有肾受累的临床表现。IgA肾病的鉴别主要基于肝硬化。
