肛周脓肿通常建议手术治疗，保守治疗难以根治且容易复发。肛周脓肿是肛门直肠周围软组织或间隙内发生的急性化脓性感染，一旦形成脓肿，手术是主要的治疗方式。
肛周脓肿形成后，脓液无法自行完全吸收，单纯使用抗生素或局部热敷等保守治疗，只能暂时控制炎症，无法清除脓腔内的感染物。随着病情发展，脓肿可能自行破溃，或向更深、更广的间隙蔓延，形成复杂性肛瘘，增加治疗难度和患者的痛苦。手术的核心目的是及时切开引流，将脓液排出，降低局部压力，缓解剧烈疼痛，并控制感染扩散。对于大多数肛周脓肿，标准的术式是脓肿切开引流术，医生会在脓肿最表浅的位置切开一个小口，排出脓液，并清理坏死组织。部分患者如果合并有内口，医生可能会根据情况选择一期行肛瘘切开术或挂线术，以期一次性解决脓肿和潜在的肛瘘问题。拖延手术或拒绝手术，可能导致感染加重，引发全身性感染如败血症，或形成更复杂的肛瘘，后续治疗将更为棘手。
术后护理对康复至关重要。患者需遵医嘱使用高锰酸钾溶液或温水坐浴，每日2-3次，以保持局部清洁、促进引流和伤口愈合。饮食上应增加蔬菜水果等富含膳食纤维的食物摄入，多喝水，保持大便通畅，避免辛辣刺激性食物和饮酒，减少对创面的刺激。同时，注意休息，避免久坐、久站和剧烈运动，以防伤口受压或撕裂。定期回医院复查，让医生评估伤口愈合情况，确保引流通畅，防止假性愈合导致复发。
