肛瘘不能自愈。不治疗会反复发作直肠肛管周围
脓肿，必须手术治疗。治疗原则是切开瘘管，形成开放伤口，促进愈合。手术方法有很多，应根据内口位置、瘘管与肛门括约肌的关系来选择。手术的关键是尽量减少肛门括约肌的损伤，防止
肛门失禁，避免肛瘘复发。1.瘘管切开术是切开所有瘘管，通过肉芽组织生长愈合伤口的一种方法。适用于低位肛瘘。由于瘘管低于外括约肌深部，切开后只损伤外括约肌下部和浅部，术后无肛门失禁。2.挂线疗法是利用橡皮筋或腐蚀性药线的机械压迫，缓慢切开肛瘘。该方法还具有操作简单、出血少、换药方便、橡皮筋脱落前无皮肤切口粘附等优点。3.肛瘘切除术切除瘘管，将瘘管壁全部切除至健康组织，伤口不缝合；如果伤口较大，可以部分缝合，部分打开，填充油纱布，使伤口从底部生长到愈合。适用于低简单的肛瘘。同时，应注意：肛瘘术后伤口敷料的更换是确保手术成功的关键问题。
