儿童抽搐的可能原因更为复杂，许多是由于一些神经系统本身的疾病，维生素D发热性疾病引起的缺乏和问题。
神经系统本身的疾病会导致肌肉抖动，这是抽搐的常见原因。一般来说，癫痫、脑炎和脑膜炎可直接导致脑神经系统异常和抽搐。儿童癫痫的发生并不少见，主要是由脑神经异常放电引起的。抽搐的时间长短和严重程度不同。脑炎、脑膜炎等脑炎性疾病也可引起脑损伤和抽搐。其他罕见的脑肿瘤可由局部压迫神经引起。
维生素D缺乏是最常见的营养代谢性疾病，可引起儿童抽搐D缺乏会导致儿童体内钙、磷等电解质的代谢异常，神经和肌肉接头处的电化学物质发生变化，导致抽搐。这种疾病不仅会发生这个问题，还会导致骨骼异常。轻者容易情绪激动，重者容易鸡胸O形腿、X骨发育异常的后遗症，如形腿，需在早期发病后及时补充。
由于儿童神经系统发育不成熟，发烧，特别是高烧时，容易引起抽搐，称为高烧抽搐，通常并不少见。这主要是由于高烧后神经传导异常，导致抽搐，有些儿童，即使发烧温度不是很高，也容易出现这种情况，这是一种儿童需要急诊的疾病。
儿童抽搐后，必须注意保护儿童，避免抽搐期间的意外伤害，并及时给予医疗救助。
