潜伏期10～60平均40天。临床表现与甲型肝炎相似，不发展为慢性。儿童多为亚临床感染。常见的临床类型有：
1.急性黄疸 占显性感染的比例86.5％。与甲型肝炎相同的临床三期症状可持续到黄疸4～5天空。淤胆比较常见。总病程为4～6周。
2.急性无黄疸 与甲型肝炎相似。
3.淤胆型 比较常见，病程可达2个月以上。
4.重型 约占5％。高危因素包括：①妊娠妇女;②年老体弱者；③合并HBV感染。多为急性重型。
5.与其他病毒混合感染
(1)HEV与HAV同时或先后感染者：不加重病情。
(2)HEV与HBV重叠感染者：病人HBV常有活动复制，HEV不易清除。病情容易延迟或反复发作。病情严重，发生重症的人很多，印度报告80.7％急性重型和75.5％亚急性重型为HBsAg携带者重叠HEV感染引起。
根据流行病学数据、临床特征和常规肝功能试验结果作为临床诊断的参考，结合特殊的血清病原体检测仍然是诊断。同时排除HAV、HBV、HCV、HGV、TTV、CMV和EBV等等。当有两种或两种以上病毒病原体时，应考虑重叠或合并感染。
