大多数原发性气管恶性肿瘤生长在软骨环与膜的交界处。鳞状上皮细胞癌可出现突入气管腔的肿块或溃疡形成溃疡，有时癌变可渗入长气管。晚期病例通常通过纵隔淋巴结转移或扩散到肺组织，并可直接侵入食道、喉返神经和喉咙。囊性腺样癌一般生长缓慢，转移较晚，有时在长粘膜下或纵隔下生长。有些肿瘤是哑铃状的，一小部分进入气管腔，大部分位于纵隔，晚期病例可侵入纵隔和支气管。
原发性气管良性肿瘤种类繁多，形态各异。大多数肿瘤生长缓慢。表面光滑，粘膜完整，常有肿瘤蒂，无转移。但如果切除不彻底，很容易复发。乳头状肿瘤多发生在气管膜部，突入气管腔底部，常有细蒂，大小从毫米到毫米不等。2cm。有时是多发性的，表面呈疣状，软脆易脱落，破裂时出血。
