每家医院治疗疾病的方式不同，但不可否认的是，随着微创技术的发展，手术治疗是临床应用最广泛的治疗技术，肛瘘也是如此，但如果病情不是很严重，建议选择药物治疗，同时饮食，以下是肛瘘治疗的常见方法总结如下：
包括内洽法和外治法。
(一)内治法
1.清热利湿：瘘管外口流粘稠脓、白色或黄色，外口闭合，局部肿胀疼痛，排尿不良，
舌红、苔黄腻、脉滑数等症状，为湿热结。清热利湿。土医之家常用消痔栓。
2.清热解毒：肛瘘外口闭合、寒冷发热、局部红肿、灼烧疼痛、舌红、苔黄、脉搏数量等症状，为热毒。治疗热解毒。选择通常使用仙
3.养阴托毒：凡出现瘘管外口凹陷，周围颜色晦暗，脓水清稀，舌红少津，少苔或无苔，脉细数无力等症状，属阴虚型肛瘘。治宜养阴托毒。选方常用青蒿鳖甲汤加减。
4.补气补血:肛瘘经久不愈，肉芽不鲜，脓液不多，身体消瘦，肤色无华，气短懒言，舌淡，苔白，脉弱无力，属于气血不足。治疗益气补血。十大补汤常用于选择。
(二)外治法
1.外洗法：局部红肿疼痛时，可用苦参汤加减，趁热将煎水熏洗。
2.外敷:土医之家痔疮膏等外敷可用于肛瘘急性期。
以上介绍主要针对病情不是很严重的治疗方法，但需要明确的是，如果不是手术治疗，那么大多数治疗方法更麻烦，如：外部治疗，需要患者每天护理，当然，效果更好。
