在肛瘘的治疗中，最常见的方法是药物治疗和手术治疗。在大多数情况下，药物治疗是主要的。在药物治疗措施中，中医的效果相对明显，但缺陷是治疗时间相对较长。以下是肛瘘治疗的常用方法总结如下：
包括内洽法和外治法。
（一）内治法
1.清热利湿：凡出现瘘管外口流粘稠脓，色白或黄，外口闭合，局部肿胀疼痛，小便不利，
舌红、苔黄腻、脉滑数等症状，为湿热结。清热利湿。土医之家常用消痔栓。
2.清热解毒：肛瘘外口闭合、寒冷发热、局部红肿、灼烧疼痛、舌红、苔黄、脉搏数量等症状，为热毒。治疗热解毒。选择通常使用仙
3.养阴托毒:阴虚型肛瘘是出现瘘管外口凹陷、周围颜色暗沉、脓液稀疏、舌红少津、苔藓少或无苔藓、脉细数无力等症状的阴虚型肛瘘。治疗阴托毒。常用青蒿龟甲汤加减。
4.补气补血:肛瘘经久不愈，肉芽不鲜，脓液不多，身体消瘦，肤色无华，气短懒言，舌淡，苔白，脉弱无力，属于气血不足。治疗益气补血。十大补汤常用于选择。
(二)外治法
1.外洗法：局部红肿疼痛时，可用苦参汤加减，趁热将煎水熏洗。
2.外敷:痔疮膏等外敷可用于肛瘘急性期。
我们必须注意是，任何肛肠疾病都有复发的特点，肛瘘疾病也是如此。在这种情况下，作为肛瘘患者，在治疗过程中和治愈初期必须避免一些禁忌。
