先天性畸形的原因有很多:
1.多指(趾)、并指(趾)哥短指(趾)等遗传因素与遗传有关。
非遗传因素，也有非遗传因素，如孕妇在怀孕前三个月感染风疹，风疹病毒可通过胎盘屏障引起胎儿畸形，在此期间延迟反应停止，常引起肢体畸形。
2.子宫环境的变化，如孕妇创伤、羊膜破裂、羊水减少等，可导致四肢狭窄，严重者可产生宫内截肢。
羊水减少，子宫体积减少，也会导致马蹄内翻。
3.X一旦卵子和精子受损，线对胎儿、暖巢和睾丸也会造成损害X线损伤，将会遗传、影响下一代发育。总之，引起先天性畸形的因素很多，其病因研究呃比较复杂。
