炎症
如肛周脓肿、溃疡性结直肠炎、梅毒、克隆病、性病淋巴肉芽肿、结核病、慢性痢疾、结核病、复杂肛瘘、阿米巴肠病、血吸虫肠病等，可使肛肠结缔组织增生肥厚，形成直肠疤痕，或直肠壁充血、水肿、静脉、淋巴回流阻塞，结蹄组织增生使肠失去弹性，使管腔狭窄，形成疤痕。
手术及手术不当
一个常见的临床原因是手术治疗不当，如内痔粘膜切除过多，外痔皮肤切除过多。如内痔或直肠脱垂硬化剂或坏死剂注射过多或集中在一个平面上，或外痔注射过多面积过大。其中，注射治疗占46％.37％；太多了。或者用枯痔疗法等腐蚀性药物“压缩丹”肛管直肠损伤或直肠吻合不当会导致瘢痕挛缩和狭窄。这是肛管直肠瘢痕最常见的临床原因。二是意外损伤，如肛门直肠刀伤，最常见的是高坠落伤、异物损伤等疤痕狭窄。
