目前认为产后甲状腺炎是一种自身免疫性淋巴细胞性甲状腺炎，发现女性亚临床甲状腺炎的发病率(8.5％；）与产后甲状腺炎的发病率相似，尸检发现抗甲状腺抗体与甲状腺细胞浸润有关，因此认为产后甲状腺炎是由产后免疫反应再次活跃引起的。
怀孕期间，为了使不同抗原的胚胎植入并存活在母亲体内，母亲的细胞免疫和体液免疫受到抑制，抗体浓度下降甚至消失，母亲对胎儿有免疫耐受性。分娩后，身体对细胞免疫和体液免疫的抑制作用消失，导致免疫反应增强，自身抗体水平提高，导致产后甲状腺炎。包括体液免疫和细胞免疫。
弥漫性和局灶性淋巴细胞渗透性和局灶性淋巴细胞渗透性，包括辅助性T细胞中的Thl优势。产后甲状腺炎和产后甲状腺炎的发生Thl/Th细胞免疫平衡倾向于Thl细胞反应与多种细胞反应密切相关Thl细胞毒作用在型细胞因子的作用下，对靶细胞造成破坏。
糖皮质激素不仅是人体应激时必需的内分泌激素，而且具有重要的抗炎和免疫抑制作用。它的分泌受到下丘脑的影响-垂体-肾
