大多发生在急性感染疾病的前三天，有些儿童发生在急性感染发病后几个小时。儿童高烧、严重头痛、呕吐、易怒、妄想甚至昏迷，常有惊厥发作，持续时间可长或短，多为全身强直发作或全身强直挛样发作。此外，还经常有阳性锥体束征、肢体瘫痪、失语症、瞳孔异常等。有明显的脑膜刺激征。醒来的儿童根据疾病的严重程度有不同的转折点。严重患者可有不同程度的视力障碍、听力丧失、颅神经麻痹、单瘫或多肢瘫痪、智力丧失等精神障碍，其他儿童从昏迷到去质或大脑强直，轻度患者可恢复，但有些仍可留下注意力不集中、学习能力下降、行为异常和性格变化等。
