(一)治疗
使用两性霉素B静脉滴注和关节内注射，或口服酮康唑和克霉唑。病变清除是缩短治疗时间和治疗关节炎的重要手段。
1.念珠菌病的治疗首先要消除病因，然后用两性霉素B注射关节和静脉滴注，或口服酮康唑和克霉素。关节内病变也可以通过手术清除来治疗。
2.孢子丝菌病治疗上，据报道碘制剂疗效较好。方法是10％碘化钾溶液，口服，每天3g，如果没有不良反应，可以每天增加到6g，治疗1~3个月，用药2周左右症状改善，皮损消退4~12周。两性霉素B静脉滴注或关节注射，用手术去除肉芽肿滑膜效果更好。关节内碘化物注射治疗也有报道。
3.两性霉素用于芽生菌关节炎B静脉滴注和关节内注射效果很好。
4.球孢子菌病治疗播散性病例，强调两性霉素B或充分利用酮康唑。切除肉芽肿结节可缩短病程。
(二)预后
球孢子菌病关节损伤过程缓慢，如果不治疗，最终会造成关节永久性损伤。
