潜伏期短，一般3～5天。原发性肺鼠疫持续数小时至3天，发病紧急，高烧伴寒战、全身毒素症状、淋巴结肿大、呕吐、腹泻、肝脾肿大、出血。肺鼠疫主要由腺鼠疫的传播引起，少数为原发性吸入性肺鼠疫。咳痰为脓痰、胸痛、咯血、呼吸困难、发绀。肺体征较少，可有少量的湿声和胸膜摩擦声。这种疾病的特征是体征与疾病的严重程度不一致。如果救援不及时，就会出现意识障碍，主要死于休克和呼吸衰竭。因为死后全身皮肤是黑紫色的，所以有“黑色病”之称。
根据流行病学资料，临床上有发热、全身毒血症状，急性淋巴结炎或咳嗽，胸痛，咳血痰，呼吸困难等表现应怀疑为鼠疫，确定有赖于病原学检查出鼠疫杆菌和(或)检测血清特异性F1抗体，效价≥1∶100或双血清抗体效率上升4倍以上。
