HI鉴别以下疾病：
1.由交感神经损伤引起的虹膜异色 动物实验证实了交感神经损伤可以使虹膜脱色。Horner综合征、Parry-Romberg综合征。Horner除单眼虹膜异色无虹膜睫状体炎症迹象外，综合征还有上睑下垂、眼球内陷、瞳孔缩小、患侧面部皮肤无汗等体征。同时，还有交感神经损伤的原因(创伤、手术、Pancoast一般容易判断肿块、主动脉瘤、颈内动脉血栓等。Parry-Romberg综合征很少见，也是单眼，没有眼病KP外与HI基本相同，可以识别患侧面部是否有肌肉进行性萎缩。
2.单纯虹膜异色症 虹膜发育异常，无炎症，眼睛多。
3.弥漫性虹膜萎缩是由慢性虹膜睫状体炎引起的可见色素KP、晶状体前囊色素沉着、虹膜后粘连等。
4.有继发性青光眼HI应与青光眼-睫状体炎综合征(glaucomatocyclitic crises syndrome)识别。两者均为继发性开角性青光眼，但后者KP在角膜后面呈三角形分布，圆形，较大，KP无细丝样连接，虹膜无异色。
