结直肠子宫内膜异位症与结直肠肿瘤及炎性病变有一些共同点，临床上常需鉴别。
1.结直肠肿瘤 结直肠肿瘤的以下特点有助于鉴别：①头发年龄较大；②不孕和月经异常史很少；③病程较短;④常伴有体重减轻、恶病质、腹水等晚期肿瘤症状；⑤症状与月经无密切关系；⑥钡灌肠发现填充缺损范围小，边缘不规则但清晰，粘膜破裂。
应强调调的是，侵入性肿块应进行病理检查，以明确病变的性质，手术中发现的直肠肿块也应进行冷冻切片检查，腹部会阴联合切除术不能随意诊断为直肠癌。国内外直肠子宫内膜异位症被误认为是直肠癌，腹部会因阴联合切除术而报告。
2.结直肠炎性病变 有助于鉴别结直肠炎性病变的以下特征：①常有发热、体重减轻的病史；②白细胞计数增加；③大便常规检查和细菌培养检查异常；④钡灌肠检查显示充盈缺损长，边缘不整齐，粘膜变形，与正常部位分界不清。
