1.胃癌
食欲不振、上腹部不适、贫血等慢性胃炎症状。少数胃窦胃炎X线征与胃癌相似，需要特别注意鉴别。绝大多数患者有胃镜检查和活检。
2.消化性溃疡
两者都有慢性上腹痛，但消化性溃疡主要是腹部的规律性和周期性疼痛；慢性胃炎是疼痛，很少有规律性，主要是消化不良。识别依赖于X钡餐透视及胃镜检查。
3.慢性胆道疾病
如慢性胆囊炎、胆石症常有慢性右上腹痛、腹胀、打嗝等消化不良症状，易误诊为慢性胃炎。但胃肠检查无异常发现，胆囊造影及B最终可以诊断出超异常。
4.其他
例如，肝炎、肝癌和胰腺疾病也可能因食欲不振、消化不良等症状而延误诊断和治疗。全面细微的体检及相关检查可防止误诊。
