1.外周血 一般无明显变化。
2.脑脊液检查 约1/3PCNSL脑脊液表现为恶性淋巴细胞增多。同时，可以进行κ和λ轻链免疫组织检查及B细胞的PCR帮助诊断。
3.原发性中枢神经系统淋巴瘤最有价值的实验室检查是影像学检查，如CT，MRI，PET，99mT-SPECT(单电子计算机断层扫描)、脑扫描、血管造影等。
(1)血管造影:原发性中枢神经系统淋巴瘤多为无血管性或少血管性。
(2)99mT标记的SPECT脑扫描：原发性中枢神经系统淋巴瘤99mT吸收增加。
(3)CT：在平扫CT中，90％的PCNSL与胶质瘤、脑膜瘤、脑转移瘤等脑部肿瘤不同，患者表现出等密度或高密度的病变，CT平扫主要是低密度病变，这可能与PCNSL与其他脑肿瘤相比，病变的基础是大量的小淋巴细胞，PCNSL病变周围脑组织水肿较少。注射造影剂后，90％的PCNSL患者在CT上增强，50％为了增强均匀密度，大多位于脑皮质的凸部和腹部，约占75％。
(4)MRI：T1MRI注射造影剂后，上显示强信号，Ga-T1MRI显示比CT病变范围较大。
(5)FDG-PET：可区分原发性中枢神经系统淋巴瘤和感染引起的病变。
有些病人在CT或MRI注射造影剂后没有增强，这使得诊断困难。有人认为这与隐藏在完整血液中的病变有关-脑脊液屏障下有关。
免疫功能正常的患者和免疫缺陷患者的实验室检查也有一些差异。最明显的是，免疫缺陷患者脑多叶病变的发病率远高于免疫功能正常的患者，约为2倍(50％∶25％)。在免疫缺陷患者中，CT和MRI上多见一种特殊的环状增强(50％)，免疫功能正常的人很少。
4.双眼裂缝灯检查 房间水中淋巴细胞增多。
