肠道病毒包括脊髓灰质炎病毒、柯萨奇病毒(Coxsackie virus)、孤儿病毒致肠细胞病变(enterocytopathic human orphan virus ECHO在中医的概念中，治疗需要分为以下类型：
胃肠湿热型
发病快，恶心频繁，呕吐吞酸，腹痛阵作，腹泻急迫(内急后重)，便行不爽，便色黄褐臭，口渴欲饮，心烦，尿短红少，苔黄腻，脉数或滑数。
治疗清热化湿，理气化胃。药用葛根芩汤加减:葛根20克，黄芩15克，黄连15克，生甘草10克，金银花12克，茯苓10克，车前12克(煎)，白扁豆9克，荷花10克。每天煎一剂。
腹痛甚者，加白芍、木香理气缓中;呕吐甚者，先吞服玉枢丹以辟浊止呕;夹食滞者，加神曲、麦芽、山楂等消滞品。
2.寒湿阻滞型
呕吐清水，恶心，腹泻如水，腹痛肠鸣伴胃寒发热，颈部或全身关节疼痛，苔藓薄白或白腻，脉冲。
治疗疏邪化浊，散寒除湿。药用藿香正气散加减:大腹皮9克，白芷9克，紫苏9克，半夏曲9克，白术10克，陈皮10克，厚朴10克，桔梗10克，藿香15克，烤甘草6克。每天煎一剂。
寒热者可加荆芥，防风；头痛者加羌活，独活；如有宿滞伴胸闷腹胀，去白术，加神曲，鸡内金消食导滞。
食滞胃肠型
恶心厌食，食欲不振，呕吐后发快，腹痛，腹泻，急迫不爽，腹泻后疼痛减轻，苔厚腻，脉滑实。
治疗消化滞和胃逆。药用保和丸加减:焦山楂15克，神曲10克，茯苓10克，陈皮6克，连翘6克，炒萝卜6克。水煎，每天一剂。食滞甚至化热，大便泻而不爽的人可以利用情况，用苦涩的药丸导致滞丸；如果胃里有热呕吐，可以加竹茹、赭石等。
