骨化性肌炎诊断确立后，肘关节应得到妥善保护。是否进行主动关节活动取决于情况。如果局部肿胀、压痛和温度升高，活动时疼痛加重，则不应过度活动。如果上述症状不明显，应在疼痛可忍的情况下进行运动，以保持一定程度的关节活动和功能。有些人认为放疗可以影响炎症反应过程，预防骨化性肌炎。每周2次，4周1个疗程200R。
只有影响肘关节屈伸功能，骨化性肌炎静止，即异位骨化致密硬化，边界清晰，才能考虑手术切除。切除术的目的是防止任何与骨化块有关的肌肉和骨组织残留，以防止复发。切除时，骨化块应与一层正常肌肉相同，完全止血，术后石膏应固定1~3周。
