在组织细胞增殖的病理显微镜下，可以看到大量含有胆固醇的网状内皮细胞，细胞较大，细胞浆呈泡沫状。组织细胞增殖中嗜酸性肉芽肿位于颅骨，一般表现为内外板溶骨损伤，骨似乎被挖出，周围无硬化或骨膜反应，如地图所称“地图颅”。
脊柱骨病理性骨折，椎体部分压缩为楔形椎，然后完全压缩，只有上下皮层，椎体高度降低，但水平方向不扩散，上下椎间隙保持不变。椎体之间没有自发的融合，偶尔在椎体旁边会出现软组织梭形肿块。椎体密度增加，呈圆盘状，因此脊柱嗜酸性肉芽肿通常是典型的X线性表现为扁平椎，颅像椎体软骨病。
对于X线片显示扁平椎，诊断为骨嗜酸性肉芽肿时应谨慎，适用于以下标准，即：
只有一个椎体累及。
2.上下椎间隙正常。
3.压缩椎体密度一致，肺X线性表现为支气管炎或支气管扩张，肺内有弥散性网状结节渗透，肺门周围放射密集细条，有弥散性爪状物。严重者呈蜂窝状，肺门增大，纹理密集。
