一、治疗
1、气管支气管囊肿较大的气管支气管囊肿一般应进行手术切除治疗。无临床症状、手术耐受性良好的患者可选择性手术；呼吸道压迫症状明显（多见儿童）有时需要急诊手术；囊肿继发性感染者可先进行抗生素和局部排水治疗，感染控制后再进行手术切除。手术治疗效果良好，但个别患者术后囊肿可复发。
2.食管囊肿手术切除术是本病唯一的治疗方法。
3.胃肠囊肿手术切除术是本病唯一的治疗方法。为避免气管支气管瘘、食管瘘、胸椎损伤等并发症，应争取早期明确诊断和早期手术治疗。
4.心包囊肿一般不需要治疗，症状明显的可以手术切除。
5.胸腺囊肿的手术治疗不仅可以切除囊肿，还可以帮助明确组织诊断。胸腺囊肿切除后不复发，预后好。
二、预后
气管支气管囊肿手术治疗效果好，但个别患者术后囊肿可复发。胸腺囊肿切除术后不复发，预后好。
