胚胎期第四周动脉共干主动脉-肺动脉间隔分为通往左心室的主动脉和通往右心室的肺总动脉。然后在主动脉和肺总动脉根部内壁生长三片半月瓣。如果动脉共干分隔不均匀，半月瓣和/或主动脉根发育异常，则主动脉瓣膜、瓣环或瓣上狭窄可出现在出生后，先天性主动脉瓣膜狭窄也可伴有主动脉瓣下纤维隔膜狭窄或主动脉瓣上狭窄，常有主动脉狭窄或二尖瓣和左心室发育不良。因此，近年来，人们认为，至少一部分主动脉瓣狭窄的病例与胎儿期左右心室出血严重失衡有关。正常情况下，从下腔静脉回流到右心室的血液通过卵圆孔进入左心室，然后通过左心室排出。从上腔静脉回流到右心室的血液通过右心室排出到肺动脉后，大部分通过动脉导管进入主动脉，只有少部分进入肺循环。如果胎儿期卵圆孔小，血流阻力高，从下腔静脉回流到右心室，大量血流到右心室，影响主动脉和主动脉的正常生长发育。
