1.、贫血、低蛋白血症：慢性化脓性骨髓炎病程延长，长期反复急性发作，低热和窦内脓性分泌物排出，会对全身造成慢性消耗性损害。贫血和低蛋白血症是慢性化脓性骨髓炎的常见并发症。这些并发症的存在进一步降低了全身和局部的抗病能力。慢性化脓性骨髓炎的治疗增加了不利因素，形成恶性循环。因此，纠正贫血和低蛋白是非常重要的。
2、全身淀粉样变：淀粉样变是一种病理组织变性，分为全身性和局限性。全身淀粉样变并发于慢性化脓性骨髓炎等长期反复化脓性炎症。病理学表现为全身器官的细胞间隙和血管基底膜上淀粉样物质的沉积。沉积物实际上是一种蛋白质物质，但它具有碘变蓝的性质。病变器官经常发生严重的功能损伤。
3、骨不连：病理性骨折发生后未及时正确治疗，可发生骨连接。此外，在骨包壳完全形成之前，手术治疗也会导致骨缺损或骨连接。由于局部血液循环不良，骨损伤仍在继续，骨折愈合非常困难，随着时间的推移，使整个治疗更加复杂和困难。假关节分为两种，一种是接触型，另一种是大骨缺损型，后者更难治疗。
4、化脓性关节炎：骨骺端化脓性骨髓炎，脓肿可通过两种方式进入关节腔并合并化脓性关节炎。一是通过骨骺板血管交通支，脓肿穿透关节软骨直接进入关节，形成化脓性关节炎。
