儿童再生障碍性贫血的发病可能与以下因素有关：
1、药物
药物是最常见的发病因素。
二、化学毒物
苯及其衍化物与再生障碍性贫血的关系得到了许多实验研究所的肯定。苯进入人体，很容易固定在富含脂肪的组织中。当慢性苯中毒时，苯主要固定在骨髓上。苯中毒再生障碍性贫血可为慢性或急性严重性贫血，但后者多为后者。
三、电离辐射
Ｘ线、γ线或中子可以穿过或进入细胞，直接损害造血干细胞和骨髓微环境。长期超允许辐射(如辐射源事故)会导致这种疾病。
4.病毒感染
病毒性肝炎与再生障碍的关系得到了肯定，被称为病毒性肝炎相关性再生障碍，是病毒性肝炎最严重的并发症之一。肝炎病毒可直接抑制造血干细胞和染色体畸变。
5.免疫因素
再生障碍可继发于胸腺瘤、系统性红斑狼疮和类风湿性关节炎，抑制血干细胞的抗体可在患者血清中找到。
6.遗传因素
Fanconi贫血是一种常染色体隐性遗传性疾病，具有家族性。
7、发性睡眠性血红蛋白尿（PNH）
儿童再生障碍性贫血PNH与再障相当密切。
