1、实验室检查：除尿液分析和尿培养阳性外，其他检查结果与肾皮质脓肿相同，因为肾皮质髓质脓肿与肾盏肾盂相连。与肾皮质脓肿相比，本病血培养阳性率较高。
2、影像学检查：超声和CT是肾皮质髓脓肿最基本、最有效的诊断方法，急性局灶性细菌性肾炎、肾超声检查常无异常，但可显示固态低回声肿块，与正常肾周围无明显界限，肾轮廓变形、皮质、髓分辨，无造影剂增强CT常不能证实急性局灶性细菌性肾炎的症状，然而经造影增强后，CT楔形和非液化低密度区可以累及一个或多个肾小叶，可以显示边界不清楚。
肾脓肿，无论是肾皮质还是肾皮质髓脓肿，其超声表现反复多变，病变可与肾囊肿或肾灯憩室相似，或强回声光团类似肿瘤，理想的图像检查是CT，肾实质性病灶的特征表现是肾实质性病变CT值下降至0～20H静脉注射造影剂后，单位无法增强。
