研究表明，尿道综合征主要与以下原因有关：
1.泌尿系统感染，尿道口组织病理变化为慢性炎症反应。
尿道梗阻：如膀胱颈梗阻、尿道远端周围组织纤维化或括约肌痉挛，导致远端尿道萎缩。
3、尿道外口解剖异常，如尿道处女膜融合、处女膜伞、小阴唇融合等。有报道，尿道外口至阴道口距离与尿道综合征关系密切，间距越近患病率越高，间距在3mm患病率为72.15％。
4经功能异常，损伤，感染，X线照射引起尿道纤维组织增生，导致神经异常反射。
5.心理因素。紧张、焦虑、多疑、内向等心理状态是尿道综合征的易感因素。
6.免疫因素、雌激素水平下降、镁离子缺乏、医源性因素等。
