每天氟细菌尿对氟细胞嘧啶50~150mg/kg每6小时口服一次1~2每周都有效，但经常有抵抗力。氟康唑似乎是新型抗真菌衍生物中最有效的真菌性尿路感染，因为它的口服生物利用率高，每天服用一次剂量，具有良好的进入尿液和脑脊液的穿透力。氟胞嘧啶或氟康唑200mg/d无症状性念珠菌尿病患者应口服。
无导尿管症状性膀胱炎患者可治疗氟胞嘧啶或氟康唑1~4周。单剂量两性霉素B0.3mg/kg静注也有很好的疗效。当导尿管长期保留时，氟嘧啶和氟康唑可以减少真菌尿，但很少根除。膀胱冲洗可能有效。
在患肾念珠菌病的病人中，以两性霉素B大剂量氟康唑（≥400mg/d）与白色念珠菌和热带假丝酵母菌的侵袭性感染初期治疗同样有效。即使在开始时，也使用两性霉素B，治疗早期也应取代口服氟康唑。然而，一些罕见的念珠菌种对氟康唑不敏感。
