治疗卵巢功能异常综合征主要分为两个方面：
一、一般治疗 主要用镇静药、止痛药、抗组胺药、谷维素等来调节脑间脑系统的自主神经功能障碍。
谷维素10mg～20mg，3次/d，连服1～2口服对调节自主神经功能有很好的疗效。
2.维生素B620～40mg，口服，3次/d，对谷氨酸代谢有影响，可用于调节自主神经系统和下丘脑-垂体-卵巢关系。
3.锂离子能改变神经的兴奋性，具有排钠利尿的作用，每次月经前10天服用300mg，3次/d，月经后停药。
二、内分泌治疗 可以治疗月经紊乱和生殖器发育不全，以调节月经，促进生殖器发育。
