巴马瑶族自治县民族医院创建于1995年，占地面积约4.67亩，建筑面积为4556平方米，编制床位60张，现有编制46名，实有干部职工92人，其中副主任医师2人，主治医师7人，医师24、护士25人；开设有壮医、针灸推拿、内、外、妇、儿、检验、放射、B超、手术室等15个临床、医技科室。做为一家公立性民族医医院，医院一直重点发展壮医科、针灸推拿科等特色科室。

建院20年来，历届领导班子始终坚持从医院实际出发，一手抓医院内涵建设，不断强化医疗质量管理和医德医风建设，一手抓医院硬件建设，不断更新医疗设备，逐步改善就医环境；全院干部职工团结奋斗，艰苦创业，勇于创新，积极进取，医院每年的诊疗人数、社会效益和经济效益等各项指标实现逐年递增，医院建设取得了跨越式的发展。

随着最近几年国家从政策上对西部贫困地区中医药事业的发展给予大力扶持，巴马民族医院一直重点扶持发展的壮医科和针灸推拿科在2010年被列为“广西卫生厅民族医重点专科”。自从成立这两个重点专科以来，医院的中医、民族医诊疗项目的业务量逐年快速增长，这两个专科也已经成为医院的支柱科室。目前，医院壮医科和针灸推拿科在运用民族医疗法为广大患者治病防病方面具有显著的疗效，赢得了各界群众的广泛赞誉，形成了独具特色的中医、民族医专科，为振兴巴马县的中医和壮瑶医药事业奠定了良好的基础。