我院前身为甘肃省结核病院，始建于1957年。1992年12月改名为兰州市肺科医院。2003年我国一些地区相继发生了非典型肺炎疫情后,被省、市非典型肺炎防治工作领导小组确定为非典型肺炎定点收治医院。根据国家发展改革委员会和卫生部精神,甘肃省政府2003年第20次常务会议决定将我院改建为省级传染病院。2003年11月兰州市政府市长办公会议通过了《兰州市传染病医院建设方案》，于2005年3月正式开工建设，现各建筑项目已基本完成，业务用房建筑面积约3万平方米，院内绿化面积20000平方米，除履行日常医疗工作外，还担负着兰州地区及全省各类传染病的救治及各类突发公共卫生事件救治任务。今后，我院将继续完善医院公共卫生紧急救治体系。建立和完善突发公共卫生事件应急机制，提高医院危机管理水平，畅通绿色急救通道，完善医院《突发公共卫生事件紧急救治预案》，细化各个环节。加强传染病防治全员培训力度，扩展传染病培训范围，以满足各种日常传染病诊治及随时应对突发疫情。以科学发展观为指导，结合实际，坚定不移地推进医疗卫生体制改革，坚持公共医疗卫生的公益性质，深化医院改革，健全人才队伍、信息系统和法律制度等条件，积极推动医疗卫生事业与经济社会建设协调发展，保障人民群众的健康水平。