杭州市儿童医院是由杭州市政府全额投资新建的一所市属非营利性公立医院，经省卫生厅批准，按三级甲科等儿童医院建设，目前核定编制560人，核定床位500张。医院已于2009年1月29日开张运行，目前已开设儿童门急诊、儿科病房，开放床位120张，包括儿内科、儿童感染科、新生儿科和小儿外科等专业。医院儿科现为杭州市医学重点学科。承担了省科技厅、省卫生厅、市科技局和市卫生局等多项课题。承接多家高等医学院校教学任务。现有在职人员288人，其中高级职称31人，硕士以上学历38人。