作为广东省A类重点学科、广东省分子肿瘤病理学重点实验室、教育部及广东省重大疾病转录组和蛋白组学重点实验室所在单位，临床病理诊断与科研紧密结合，技术优势明显。作为广东省四大超大型综合性医院和\"全国百佳医院\"的基础诊断学科，综合实力强，病理诊断技术全面，以给患者提供高质量的技术服务著称。2006年被卫生部评定为国家级病理医师培训基地。南方医院病理科（南方医科大学病理学教研室临床病理诊断区）设有病理取材室、病理诊断室、病理技术室、分子病理室、细胞病理室、病理资料室、病理档案管理室、会诊接待与病理资料查询室等。设备配制齐全、先进，配备全自动组织脱水机、病理染色机、免疫组化仪、原位杂交仪，保证病理技术制片的质量，提高可靠性与稳定性。新技术开展完备，综合实力强病理科现有教授\/主任医师6人，副教授\/副主任医师7人，讲师\/主治医师10人；博士生导师4人，硕士生导师4人；大部分人员具有博士、硕士学位，长期从事临床病理诊断、教学和科研工作，在长期实践工作中积累了深厚的经验，病理诊断水平在全国具有较高的影响力。每年病理活检量18000人次，细胞学检查15000人次，病理冰冻检查1000人次，外院病理会诊700人次。各项病理技术开展完全，如分子病理诊断技术开展早，项目多，质量优良可靠。病理档案资料保存完整，专业性病理参考书籍齐备。临床病理诊断与国际接轨，及时更新知识体系，按新版世界卫生组织疾病分类标准进行分类与分级。接收来自全国的病理进修医生，并将招收病理诊断专业硕士及博士学位研究生，同时对病理方面的硕士、博士研究生进行较为系统的临床病理诊断培训，已培养了病理学硕、博士研究生100余人，部分毕业研究生已成为其工作单位的技术骨干或学科带头人。卫生部国家级病理医师培训基地，质量管理严格科室制定了完善的管理制度，建立了病理质量管理方案，其中包括病理标本接收与核对制度、常规病理诊断制度、冰冻病理诊断制度、临床病理联系制度、细胞病理学检查与审核制度、病理技术管理规范、病理档案管理制度、病理会诊接收与查验制度、疑难病例科内会诊与讨论制度。严格按照三级检诊、审核方案实施临床病理诊断，确保医疗安全和病理质量。我科对进入科内轮训人员的培养，按《卫生部专科医师培养细则――病理科》实施，分期、分阶段进行病理技术、病理活检、分子病理、细胞病理、尸体剖验等方面的培养，使之全面掌握临床病理诊断相关知识与技能