阿盟蒙医医院（蒙医药研究所）是1999年由原阿拉善盟蒙医药研究所和阿拉善左旗蒙医院合并组建的一所以蒙医为主，蒙西医结合，集蒙医医疗、教学、科研、蒙成药加工生产为一体的地区级民族专科医院。医院占地20694平方米，建筑面积9693.28平方米，在职职工134人，其中专业技术人员108名、高级18名、中级54名，另外有2名教授享受国家特殊津贴。医院设有六个职能科室、五大病区（设综合病床68张）、五个临床医技科室及肝胆、风湿、甲亢、糖尿病等十个专病专科门诊。医院坚持“挖掘、整理、提高、开发、应用”的民族医药发展原则和“科技兴院”的办院方针，开展临床、科研、教学工作。到目前为止，完成科研项目4项，其中蒙药《爱克泻》获国家专利，在国内外发表学术论文150余篇。在临床诊治上以病人为中心，以传统蒙药为主体，突出蒙药药浴、推拿按摩、银针火灸等传统蒙医疗法，开展各种诊疗服务，专科建设已具备科有专病，人有专长，治有专药的自身特色，特别对肝胆、胃肠、心脑血管、甲状腺、风湿、骨质增生、婴幼儿腹泻及妇科、皮肤等疾病的蒙医专科治疗形成了一定的优势；在加强人才培养方面，自99年至今先后与银川市第一人民医院、新疆库尔乐市蒙医研究所建立对口支援单位，与内蒙古民族大学联合举办蒙医大专、本科等，采取对口支援、技术交流与合作、联合办学等形式，使医院整体业务素质有了明显提高，为阿盟及周边地区蒙医事业培养更多后继之才；在加强基础设施建设、提高医院综合实力方面，通过贷款、分批付款等方式，美化硬化院落、改善就诊环境，对医疗科研蒙药制剂设备进行逐步配套建设，有力地促进了诊疗水平、科研水平的提高以及蒙药研制开发的进程；在加强医院内涵建设、增强医院内部活力方面，在全盟卫生系统中首家实施了以人事、分配、目标管理体制为内容的内部运行机制的改革，开展创建“二级甲等”医院活动。2000年盟委、行署提出将阿盟蒙医医院建成西部地区最好的民族医疗和蒙医药开发中心，并列入全盟经济社会发展总体规划。为此目标，建成了全盟蒙药联合制剂中心，医院在蒙药研发、规范制剂生产操作规程及蒙成药剂型改革方面取得较好的成绩，制剂中心生产蒙成药的每个工艺流程和质量要求均达到了自治区蒙成药内部制剂标准，现有散剂、煮散剂、丸剂、糖衣片、蜜丸、胶囊等剂型400余种蒙成药。近几年，阿盟蒙医医院在国家西部大开发政策的引导下和自治区蒙医药政策的扶持下，抢抓机遇、锐意改革，为推动全盟蒙医药事业的全面发展起到了示范和龙头作用。为了振兴阿盟蒙医药事业，医院愿与全国科研、教学、临床单位合作共同发展。