北京佑安医院病理科以肝胆病理诊断为特色。每年接收来自于全国各地的疑难肝脏病理会诊1100余例，每年接收6~8名来自于各地的病理医生和技术人员进修和学习。在国家卫健委和全国病理质控中心的指导和关怀下，先后3次举办召开了《全国肝脏病理诊断提高班》暨《肝脏疑难病理读片会》。目前病理科有工作人员20人：病理医生10人，技术和辅助人员10人。其中高级职称5人，中级职称（主治医师、主管技师和助研）6人，初级职称（住院医师和技师）和辅助人员9人。工作量：每年8000余例外检，4000余例细胞学检查，3~5例尸体解剖。送检标本以肝脏为主，包括肝脏穿刺2000余例、肝脏肿瘤手术切除300多例、肝脏移植100余例。北京佑安医院作为北京市10个重大疾病临床数据和样本资源库建设的主要成员单位，承担了肝脏疾病、艾滋病和新发传染病样本库的建设。病理科牵头肝脏疾病病理组织样本库建设。先后参与和承担了国家十一五、十二五和十三五国家科技重大传染病专项子课题多项：《建立HBV相关肝脏纤维化无创诊断标准\/模型的研究》的病理部分，《蛋白质及多肽等关键分子用于肝癌防治新策略的研发》的病理部分，还承担了北京自然基金及其它肝病艾滋病基金多项。