广州医科大学附属口腔医院现有三个院区，其中越秀院区（总部）位于广东省广州市越秀区东风西路195号，始建于2004年，建筑面积约38000平方米，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健于一体的三级甲等口腔专科医院，是广州市医保和新农合定点医院，是广东省口腔组织修复与重建工程技术研究中心，是国家医师资格考试实践技能考试（口腔类别）考试基地、广东省示范性口腔医学人才培养示范基地、广东省实验教学示范中心、广东省大学生校外实践教学基地、广东省博士工作站、广州市博士后创新实践基地、广州市重点实验室、广州市口腔疾病防治技术指导中心等。