临床上经过四到八周治疗后可完全治好，复发的几率是比较小，但如果是由于肺结核或者肺肿瘤而导致的肺脓肿，临床上复发还是比较严重，肺脓肿未经积极的治疗，病情也会出现反复，出现慢性的肺脓肿。

如果出现的肺脓肿的复发，需要进一步完善支气管镜检查明确是否合并肺结核和肺肿瘤，如果合并肺结核和肺肿瘤，需要使用相应的抗结核、抗肿瘤治疗，包括使用异烟肼、利福平、脾性酰胺链霉素，手术治疗，放疗，化疗和靶细胞药物治疗，如果出现复发，病情迁延不愈，考虑手术的治疗方法。

1、脑脓肿切除术：脓肿的位置相对较表浅，体积较大，脓肿壁较厚，通过手术完整切除，复发的概率较小。在神经外科手术的过程中，要注意妥善保护脓肿周围的正常脑组织，尽量避免脓液外溢。手术切除脓肿后，冲洗脓肿腔、蛛网膜下腔，尽量减少颅内感染发生的风险，复发的概率也较低；

2、穿刺抽吸术：位置较深的浓肿或薄壁脓肿，通常采取微创穿刺抽吸，将脓液抽吸排出，再采用静脉抗炎治疗，通常效果较好。如果未将脓肿切除，则存在一定复发的风险。

此外，脓肿是否复发与全身的营养状况、免疫力、脓肿来源有关，比如亚急性感染性心内膜炎、支气管扩张等基础病未及时治好，术后也容易复发，或者在其他部位形成新的脓肿。